Permettre aux ingénieur·es, chercheur·euses et doctorant·es en microscopie d’acquérir les bases des statistiques appliquées à l’imagerie afin de produire, analyser et valider des résultats quantitatifs robustes. La formation vise à renforcer la compréhension des méthodes statistiques, à améliorer la conception des plans d’expériences et à favoriser le dialogue interdisciplinaire avec les statisticien·nes. Elle contribue également à diffuser les bonnes pratiques au sein de la communauté et à renforcer la qualité, l’efficacité et la reproductibilité des travaux scientifiques.

• Ingénieur·es des plates-formes d’imagerie cellulaire
• Chercheur·euses, ingénieur·es et doctorant·es utilisant ces technologies en équipes de recherche

• Concepts fondamentaux en statistiques nécessaires à l’analyse de données issues de la microscopie (types de variables, distributions, tests statistiques) : quizz et rappels.
• Lecture critique d’articles scientifiques en sous groupe puis présentation pour utiliser la terminologie, identifier les raisonnements statistiques, les limites et les biais des analyses statistiques
• Echantillonnage 2D, 3D, stéréologie et analyse quantitative d’images
• Conception des plans d’expériences adaptés à l’imagerie, en intégrant les contraintes liées à l’acquisition et à l’analyse d’images. 
• Statistiques descriptives et estimation ponctuelle, intervalles de confiance, visualisation de données en choisissant les méthodes statistiques appropriées : rappels 
• Modélisation statistique (régression, ANOVA, modèles imbriqués)
• Travaux dirigés sur des données réelles

• Avoir des connaissances de base en analyse d’images (connaitre les bases de la segmentation et des mesures possibles en 2D, 3D et au cours du temps) 
• Cette formation est centrée sur l’application des statistiques à l’imagerie biologique. Elle n’aborde l’analyse d’images que de manière succincte, sous forme de rappels. L’objectif principal est de permettre aux participants et participantes de comprendre les principes qui sous-tendent les choix statistiques : appliquer un test sans en connaître les hypothèses peut en effet mener à des interprétations erronées ou à des procédures sous-puissantes. La formation ne propose pas de solution clé en main, car chaque projet possède ses propres spécificités. Il ne s’agit donc pas de suivre un pipeline unique, mais de s’approprier une démarche adaptable à chaque contexte
• Pré-requis opérationnel : avoir un ordinateur portable avec des droits permettant l’installation du logiciel libre JAMOVI et des librairies qui seront utilisées lors de la formation (https://www.jamovi.org/)

• Axe 1 : Introduction, éthique et fondamentaux en imagerie et statistiques
• Axe 2 : Principes statistiques de base et mise en pratique
• Axe 3 : Modélisation et plans d’expérience
• Axe 4 : Echantillonnage, stéréologie en imagerie

Les nuitées pourront être prises en charges pour une partie des participant·es, merci de nous spécifier votre besoin.

Les repas du midi et le diner commun du 5 Novembre seront pris en charge.

Pour les agents CNRS, les frais de déplacement sont à la charge de votre délégation régionale.

Pour les agents non CNRS, ces frais sont à la charge de votre employeur ou du laboratoire.

Date limite d’inscription : 3/07/2026

Inscription via SYGEFOR uniquement pour les personnes dans les unités dont le CNRS est une tutelle